شهر باجگیران در استان خراسان رضوی دارای محله‌های مختلفی است که هر کدام ویژگی‌های خاص خود را دارند. برخی از محله‌های شهر باجگیران عبارتند از:

1. محله مرکزی
2. محله باغشیر
3. محله چمکنه
4. محله پایین‌محله
5. محله بالامحله
6. محله حسین‌آباد

این محله‌ها دارای تاریخ، فرهنگ و ویژگی‌های خاص خود هستند.